生物医药基地建设主体工程是基地建设的主要内容，今明两年，长春市首先要进行的主体建设工程有八项。

　 长春生物制品研究所的疫苗、菌苗、基因工程药物生产基地改造扩建工程。

　 其它七个项目分别是，长春长生科技股份公司的流行性感冒病毒灭活裂解疫苗高技术产业化示范工程项目，吉林修正药业集团长春高新生物医药科技园项目，吉林大学通源生物工程有限公司与乌克兰国际合作生产干细胞制剂项目，吉林亚泰制药有限公司的生物中药项目，长春海伯尔生物技术有限责任公司的重组干扰素α—2b注射液产业化项目，长春金赛与长生基因药业的基因工程药物生产项目，国家生物医药研发工程中心和国际生物中药与中药现代化工程研究中心两个平台建设项目。